AP22686112 «Перифериялық артерия ауруы бар науқастарда машиналық оқыту әдістерін қолдана отырып, бір жасушалы РНҚ деректерінен соматикалық мутацияларды зерттеу»

Жоба өзектілігі

Перифериялық артерия ауруы (ПАА) жүрек-қан тамырлары ауруларының (ЖТА) құрамында мүгедектік пен өлімнің негізгі себептерінің бірі болып табылады. Қазіргі диагностикалық әдістер әрқашан жеке генетикалық бейімділікті анықтай алмайды. Жасанды интеллект пен генетикалық құралдарды пайдаланып, соматикалық мутацияларды анықтауға арналған тиімді pipeline құру диагноз қоюдың дәлдігін арттырып, емдеуді жеделдетуге және денсаулық сақтау жүйесінің жүктемесін азайтуға мүмкіндік береді.

Жоба мақсаты

Бұл зерттеудің негізгі мақсаты - Gemini, Cosmic және Monocle сияқты құралдар және әртүрлі машиналық оқыту әдістерін пайдалана отырып, перифериялық артерия ауруы (ПАА) бар пациенттеріндегі соматикалық мутацияларды анықтау үшін инклюзивті pipeline құру. Бірінші жылдың мақсаты: Алдын ала есептеу құралдарына шолу жасау және солар бойынша және ген экспрессиясын кластерлеу құралдары бойынша шолу қағазын жазу.

Күтілетін және қол жеткізілген нәтижелер

Зерттеудің қазіргі кезеңінде кластерлік талдау (Өте жоғары есептеу құраладырмен жасалды, жоғары есептеу құралдарын жалға алу құжаттары жүктелген. Бұл құралдармен гендік экспрессияны және түрлі кластерлерлеу алгоритмдері арқылы кластерлер алынды) үшін генетикалық мәліметтерді дайындаудың оңтайлы әдістері әзірленді, осыған байланысты шолу мақаласы жазылды (25-ші желтоқсан 2024-ші жылы КБТУ вестник журналында жарияланады, себебі кезектерге іліну өте қиын және мақаланы тек қаржыландыру түскннен кейін ғана жасау мүмкін болды). Осы жұмыстың нәтижесінде келесі кезеңі гендердің даму жолдарын талдауға және мутацияларды анықтауға мүмкіндік алдық.

Зерттеу тобы мүшелерінің аты-жөні, идентификаторлары (Scopus Author ID, Researcher ID, ORCID, бар болса) және сәйкес профильдерге сілтемелер

Куникеев Айдын Даулетович